47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3275 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  524  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  524  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3511  hypothetical protein  59.11 
 
 
257 aa  316  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4385  hypothetical protein  54.24 
 
 
252 aa  270  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.016831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  34.5 
 
 
253 aa  155  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000261911  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0412  hypothetical protein  33.77 
 
 
241 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2682  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.75 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4381  hypothetical protein  33.75 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3421  hypothetical protein  32.75 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0730  hypothetical protein  33.19 
 
 
261 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3835  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.834498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  28.72 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.96 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4001  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.65 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0474  putative peptidyl-prolyl isomerase  25 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139387  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.73 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0928  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.25 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  27.69 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3559  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.77 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  27.95 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1454  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.36 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  26.79 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.79 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  26.82 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  24 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0634  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.1 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137555  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  25.15 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  24.15 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  25.95 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000295507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  23.71 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.55 
 
 
301 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.62 
 
 
354 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0583  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.19 
 
 
667 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000501806  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.34 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000363046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  29.17 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  24.64 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0116  hypothetical protein  23.13 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2608  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.91 
 
 
705 aa  45.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  23.68 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1333  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.83 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.643924  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1441  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.48 
 
 
558 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  22.88 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01301  hypothetical protein  26.61 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0351  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.55 
 
 
463 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.5 
 
 
355 aa  42  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00064667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  32.73 
 
 
321 aa  42  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>