216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1080 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  100 
 
 		 447 aa  879    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  54.8 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  52.36 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  54.24 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  50.11 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  52.81 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  50.55 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  50.55 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  48.9 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  38.24 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  42.09 
 
 		 447 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  38.57 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  39.95 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  37.42 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  37.44 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  41.88 
 
 		 441 aa  298  9e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  37.42 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  36.97 
 
 		 447 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  36.97 
 
 		 447 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  40.85 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  39.47 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  37 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  37 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  37 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  37.42 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  37.19 
 
 		 447 aa  295  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  39.37 
 
 		 446 aa  292  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  39.37 
 
 		 446 aa  292  8e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  42.89 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  41.29 
 
 		 458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.47 
 
 		 454 aa  289  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.61 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  38.44 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  38.81 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2640  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.2 
 
 		 584 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  36.99 
 
 		 439 aa  272  8.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  37.83 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  41.61 
 
 		 471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.69 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  37.92 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  38.01 
 
 		 447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.36 
 
 		 453 aa  266  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.21 
 
 		 442 aa  266  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  41.88 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  41.06 
 
 		 456 aa  260  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.69 
 
 		 616 aa  259  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  38.11 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  38.89 
 
 		 454 aa  259  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  37.34 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  42.32 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  40.68 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  37.87 
 
 		 445 aa  256  7e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1352  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.88 
 
 		 448 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  36.9 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.58 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  36.9 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0458  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.33 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  36.53 
 
 		 453 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.04 
 
 		 455 aa  253  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  36.76 
 
 		 453 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  38.1 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.81 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.53 
 
 		 633 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.91 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  36.65 
 
 		 453 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  36.43 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  36.77 
 
 		 453 aa  249  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  39.37 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0444  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.72 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  35.62 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  39.11 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  35.51 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  37.16 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  36.95 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  39.91 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3754  cation transporter  40.77 
 
 		 464 aa  243  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  36.55 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1462  potassium uptake protein, TrkH family  37.02 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000505239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.94 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  35.65 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02551  putative sodium transporter, Trk family  39.22 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0138  TRK system potassium uptake protein TrkB, putative  35.97 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0138  potassium uptake protein, TrkH family  41.93 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.41 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2860  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.18 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.704642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0373  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.3 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0429  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.95 
 
 		 461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  35.52 
 
 		 454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  35.29 
 
 		 586 aa  240  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  36.38 
 
 		 467 aa  239  6.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01501  Trk family sodium transporter  38.34 
 
 		 461 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1448  putative sodium transporter, Trk family  38.34 
 
 		 461 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.225676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.65 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  35.29 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0567  TrkH family potassium uptake protein  38.81 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2746  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.05 
 
 		 457 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111298  hitchhiker  0.000348018 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  36.45 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.58 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.11 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  36.34 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>