197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  100 
 
 		 458 aa  889    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0429  H(+)-transporting two-sector ATPase  69.56 
 
 		 461 aa  588  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2746  H(+)-transporting two-sector ATPase  70.52 
 
 		 457 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111298  hitchhiker  0.000348018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0506  H(+)-transporting two-sector ATPase  67.11 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.042504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3269  H(+)-transporting two-sector ATPase  69.2 
 
 		 456 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.724123  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3346  cation transporter  56.15 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3144  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.15 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.197302 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24340  Trk-type K+ transport system, membrane component  54.51 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18030  Trk-type K+ transport system, membrane component  53.32 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.834963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  46.35 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.8 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.7 
 
 		 452 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  47.92 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  46.15 
 
 		 431 aa  342  7e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.84 
 
 		 473 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.29 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1634  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.32 
 
 		 479 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.4 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  47.63 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  46.91 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.14 
 
 		 442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0458  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.89 
 
 		 444 aa  329  7e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  45.66 
 
 		 443 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0795  Trk-type K+ transport systems membrane component  42.76 
 
 		 488 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.937253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3754  cation transporter  45.73 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4246  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.62 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2860  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.43 
 
 		 460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.704642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.1 
 
 		 449 aa  309  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4696  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.2 
 
 		 452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0373  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.28 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0444  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.51 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  36.63 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  40.68 
 
 		 443 aa  282  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  39.64 
 
 		 444 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  37.89 
 
 		 447 aa  276  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  37 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  37.7 
 
 		 447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  39.07 
 
 		 445 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  37.39 
 
 		 441 aa  273  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  37.44 
 
 		 447 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  36.49 
 
 		 447 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  36.44 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  36.44 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  36.22 
 
 		 447 aa  269  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  37.44 
 
 		 446 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  36 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  36.22 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  36.22 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  36.22 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  37.64 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  37.5 
 
 		 446 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  37.27 
 
 		 446 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  39.02 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  36.85 
 
 		 443 aa  260  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  36.57 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  39.73 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  35.59 
 
 		 447 aa  255  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.39 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  37.56 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  36.1 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  37.16 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  39.24 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  37.18 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  37.41 
 
 		 454 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  36.76 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  37.21 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  36.9 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  35.05 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  36.45 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3973  sodium transporter family protein  35.25 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1045  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.28 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1234  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.7 
 
 		 449 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  35.33 
 
 		 454 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  35.43 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.78 
 
 		 447 aa  229  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1371  sodium transporter family protein  35.92 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  37.1 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  34.54 
 
 		 443 aa  227  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  35.46 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1473  sodium transporter family protein  35.25 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.21 
 
 		 456 aa  226  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1274  cation transporter  39.39 
 
 		 442 aa  226  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  37.36 
 
 		 454 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1408  sodium transporter family protein  35.92 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1210  cation transporter  35.92 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1641  cation transport protein, putative  32.11 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  37.36 
 
 		 454 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1432  sodium transporter family protein  35.03 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1212  cation transporter  35.7 
 
 		 449 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  32.31 
 
 		 451 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1233  sodium transporter family protein  35.7 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  37.26 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1333  sodium transporter family protein  35.7 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0518  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.66 
 
 		 457 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  0.402385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  34.32 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  34.18 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  36.18 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  35.73 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  37.75 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>