218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0373 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0444  H(+)-transporting two-sector ATPase  88.51 
 
 
444 aa  759    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0373  H(+)-transporting two-sector ATPase  100 
 
 
444 aa  869    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.91 
 
 
452 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.14 
 
 
454 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  48.41 
 
 
444 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2860  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.65 
 
 
460 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.704642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.71 
 
 
449 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3754  cation transporter  48.53 
 
 
464 aa  354  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  48.42 
 
 
443 aa  350  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.53 
 
 
446 aa  346  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  48.17 
 
 
443 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0458  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.5 
 
 
444 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1634  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.98 
 
 
479 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717149  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.8 
 
 
442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.18 
 
 
443 aa  322  8e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  43.61 
 
 
469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  45.35 
 
 
432 aa  316  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.68 
 
 
473 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4696  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.2 
 
 
452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0506  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.65 
 
 
458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.042504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0429  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.89 
 
 
461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  41.96 
 
 
431 aa  300  3e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4246  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.71 
 
 
450 aa  299  8e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  43.28 
 
 
458 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3269  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.14 
 
 
456 aa  289  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.724123  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24340  Trk-type K+ transport system, membrane component  43.26 
 
 
471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2746  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.08 
 
 
457 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111298  hitchhiker  0.000348018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3346  cation transporter  41.5 
 
 
477 aa  270  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18030  Trk-type K+ transport system, membrane component  41.78 
 
 
491 aa  264  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.834963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  37.13 
 
 
445 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  39.05 
 
 
447 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  35.62 
 
 
446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  38.03 
 
 
443 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3144  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.46 
 
 
477 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.197302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  37.53 
 
 
441 aa  246  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  38.78 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  34.38 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  34.38 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  34.38 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  36.22 
 
 
446 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  34.15 
 
 
447 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  34.15 
 
 
447 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  34.38 
 
 
447 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  34.15 
 
 
447 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  34.15 
 
 
447 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  37.5 
 
 
458 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  34.15 
 
 
447 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  38.41 
 
 
471 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  33.93 
 
 
447 aa  239  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  33.93 
 
 
447 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  35.55 
 
 
446 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  36.04 
 
 
444 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.97 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  37.3 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  35.09 
 
 
446 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0795  Trk-type K+ transport systems membrane component  35.71 
 
 
488 aa  232  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.937253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  36.56 
 
 
458 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  35.97 
 
 
443 aa  229  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  34.75 
 
 
447 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  36.43 
 
 
443 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  36.32 
 
 
441 aa  222  9e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  32.33 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0518  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.67 
 
 
457 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  0.402385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  35.16 
 
 
449 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  36.18 
 
 
439 aa  218  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.91 
 
 
442 aa  216  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  34.54 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.06 
 
 
456 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  35.75 
 
 
443 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  34.39 
 
 
444 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  34.43 
 
 
422 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  33.79 
 
 
439 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  34.31 
 
 
454 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  34.57 
 
 
454 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  33.56 
 
 
439 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  33.56 
 
 
439 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  33.56 
 
 
439 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  33.56 
 
 
439 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  33.41 
 
 
454 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  33.63 
 
 
454 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  34.01 
 
 
453 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  33.33 
 
 
454 aa  203  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  34.12 
 
 
420 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  32.88 
 
 
439 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  33.33 
 
 
439 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  34.09 
 
 
453 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  33.19 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  33.19 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  32.35 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.5 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  34.16 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  32.88 
 
 
439 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  33.78 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  31.74 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  35.91 
 
 
447 aa  199  9e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  33.41 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  33.48 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1234  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.03 
 
 
449 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  32.42 
 
 
439 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  34.22 
 
 
455 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>