49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0368 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  100 
 
 		 46 aa  90.5  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  95.65 
 
 		 46 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  79.55 
 
 		 45 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  76.74 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  77.08 
 
 		 48 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  77.27 
 
 		 47 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  75 
 
 		 48 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  73.33 
 
 		 48 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  75 
 
 		 48 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  73.33 
 
 		 48 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  73.33 
 
 		 48 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  73.33 
 
 		 48 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  72.73 
 
 		 47 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  70.83 
 
 		 48 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  68.18 
 
 		 47 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  68.18 
 
 		 47 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  77.5 
 
 		 47 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  57.5 
 
 		 46 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  60.47 
 
 		 51 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  53.49 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  53.49 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  61.54 
 
 		 388 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  57.14 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  51.16 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  61.54 
 
 		 55 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  51.16 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  53.85 
 
 		 387 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2568  putative high light inducible protein  70.59 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  53.49 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  48.84 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  52.5 
 
 		 387 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  63.64 
 
 		 387 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  52.5 
 
 		 387 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1756  high light inducible protein  55.81 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540799  normal  0.134694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  44.19 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  45 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  53.85 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11191  high light inducible protein  62.07 
 
 		 45 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  53.85 
 
 		 391 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2222  putative high light inducible protein  69.7 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  44.19 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  52.5 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  54.29 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  60.61 
 
 		 71 aa  40.8  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  48.89 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  47.5 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  52.5 
 
 		 387 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  53.85 
 
 		 66 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  51.28 
 
 		 391 aa  40  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>