239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1246 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1246  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  7.78837e-06  unclonable  1.31093e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1151  pyridoxine 5'-phosphate synthase  93.06 
 
 
245 aa  424  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  89.8 
 
 
245 aa  417  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  89.39 
 
 
245 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  86.53 
 
 
245 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.661895  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1162  pyridoxine 5'-phosphate synthase  86.12 
 
 
245 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331804  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2927  pyridoxine 5'-phosphate synthase  86.53 
 
 
245 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1204  pyridoxine 5'-phosphate synthase  86.12 
 
 
245 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0207409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  86.12 
 
 
245 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0135283  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3023  pyridoxine 5'-phosphate synthase  86.12 
 
 
245 aa  408  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.316333  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2845  pyridoxine 5'-phosphate synthase  86.12 
 
 
245 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3109  pyridoxine 5'-phosphate synthase  86.12 
 
 
245 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00124308  normal  0.0210238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1351  pyridoxine 5'-phosphate synthase  85.71 
 
 
245 aa  406  1e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2763  pyridoxine 5'-phosphate synthase  84.49 
 
 
245 aa  399  1e-110  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.105389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2926  pyridoxine 5'-phosphate synthase  84.08 
 
 
265 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  82.86 
 
 
245 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.346326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.97 
 
 
246 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.19 
 
 
243 aa  353  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.78 
 
 
243 aa  352  5e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.78 
 
 
243 aa  352  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.78 
 
 
243 aa  350  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  69.55 
 
 
243 aa  350  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.72 
 
 
243 aa  350  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  69.55 
 
 
243 aa  350  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.37 
 
 
243 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.78 
 
 
243 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.66 
 
 
243 aa  348  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.66 
 
 
243 aa  348  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.66 
 
 
243 aa  348  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  70.66 
 
 
243 aa  348  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  70.66 
 
 
243 aa  348  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  70.66 
 
 
243 aa  348  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.66 
 
 
243 aa  348  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.13 
 
 
250 aa  348  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.66 
 
 
243 aa  348  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.9 
 
 
243 aa  347  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.25 
 
 
243 aa  346  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.67 
 
 
245 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.14 
 
 
243 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.83 
 
 
243 aa  340  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.83 
 
 
243 aa  340  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.83 
 
 
243 aa  340  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.83 
 
 
243 aa  340  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.62 
 
 
244 aa  339  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.49 
 
 
243 aa  339  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.01 
 
 
243 aa  335  3e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.55 
 
 
243 aa  335  3e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.36 
 
 
248 aa  320  1e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.36 
 
 
248 aa  319  2e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  67.5 
 
 
250 aa  319  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.22 
 
 
243 aa  317  9e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.56 
 
 
248 aa  315  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.98 
 
 
248 aa  313  2e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.09 
 
 
248 aa  309  3e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.29 
 
 
246 aa  306  2e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.87 
 
 
247 aa  306  2e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.98 
 
 
248 aa  305  4e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  62.87 
 
 
246 aa  305  4e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.45 
 
 
246 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.45 
 
 
246 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.29 
 
 
246 aa  304  8e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.4 
 
 
240 aa  303  2e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.92 
 
 
241 aa  302  3e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.92 
 
 
241 aa  302  3e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.17 
 
 
270 aa  297  8e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.03 
 
 
265 aa  295  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.75 
 
 
261 aa  295  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.09 
 
 
246 aa  290  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.66 
 
 
244 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.92 
 
 
254 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61 
 
 
247 aa  288  5e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.41 
 
 
254 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.83 
 
 
260 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.32 
 
 
248 aa  287  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61 
 
 
254 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.08 
 
 
251 aa  285  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.98 
 
 
255 aa  285  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.85 
 
 
240 aa  285  6e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2083  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.38 
 
 
246 aa  283  1e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.301818  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.17 
 
 
248 aa  281  6e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0031  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.87 
 
 
244 aa  278  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.75 
 
 
248 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1066  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.25 
 
 
263 aa  274  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0840275  normal  0.0462592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.34 
 
 
243 aa  273  2e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1017  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.34 
 
 
258 aa  273  2e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4249  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.34 
 
 
258 aa  273  2e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1013  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.34 
 
 
258 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.34 
 
 
258 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2167  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.76 
 
 
258 aa  272  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761233  normal  0.284873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.76 
 
 
258 aa  272  4e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1137  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.76 
 
 
258 aa  272  4e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.92 
 
 
257 aa  271  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2776  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.51 
 
 
257 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.51 
 
 
257 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.51 
 
 
257 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.51 
 
 
257 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.51 
 
 
257 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.51 
 
 
257 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.51 
 
 
257 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.8 
 
 
240 aa  268  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>