55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4289 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4289  malonate decarboxylase gamma subunit  100 
 
 		 240 aa  464  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0027  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.75 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3189  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.09 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0049  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.97 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.0466048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6854  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.55 
 
 		 238 aa  234  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3154  malonate decarboxylase, gamma subunit  57.26 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0028  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.47 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1150  malonate decarboxylase gamma subunit  55.08 
 
 		 235 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1162  malonate decarboxylase, gamma subunit  54.62 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166916 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2047  malonate decarboxylase, gamma subunit  56.54 
 
 		 235 aa  228  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1244  malonate decarboxylase, gamma subunit  54.85 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58858  normal  0.076268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0791  malonate decarboxylase gamma subunit  54.2 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1272  malonate decarboxylase gamma subunit  54.2 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00955431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4415  malonate decarboxylase gamma subunit  55.04 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2800  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.17 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3034  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.82 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0542  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.82 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.960263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1485  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.82 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1455  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.82 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0490368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0611  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.82 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1259  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.82 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.341202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1585  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.4 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.911971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0170  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.82 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.212333  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1078  malonate decarboxylase, gamma subunit  47.16 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0791  malonate decarboxylase gamma subunit  41.38 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5371  malonate decarboxylase, gamma subunit  41.38 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2892  malonate decarboxylase gamma subunit  39.73 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1765  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.12 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2495  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  43.01 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1846  malonate decarboxylase gamma subunit  40 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4017  malonate decarboxylase gamma subunit  39.33 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0076  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.77 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1143  putative malonate decarboxylase gamma subunit  33.92 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216529  normal  0.546838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  32.27 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3295  malonate decarboxylase gamma subunit  26.75 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1060  malonate decarboxylase gamma subunit  26.11 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0857455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1325  hypothetical protein  25.76 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2608  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.29 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.97 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10320  Malonate decarboxylase gamma subunit  30.4 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4929  malonate decarboxylase gamma subunit  29.53 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02590  malonate decarboxylase gamma subunit  28.16 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0619996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0296  malonate decarboxylase subunit gamma  29.73 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526825  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1243  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.3 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3775  malonate decarboxylase gamma subunit  28.72 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0446  malonate decarboxylase gamma subunit  28.82 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2442  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.25 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4589  malonate decarboxylase gamma subunit  24.66 
 
 		 280 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5298  malonate decarboxylase gamma subunit  30.95 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47948  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0950  malonate decarboxylase gamma subunit  29.24 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4817  malonate decarboxylase, gamma subunit  26.4 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0587607  normal  0.0256459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2879  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.21 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1848  putative malonate decarboxylase gamma subunit  27.35 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415688  normal  0.0801286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  29.94 
 
 		 272 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.178528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>