44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3322 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  54.55 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  46.1 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  35.76 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  32.92 
 
 		 159 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  34.27 
 
 		 154 aa  85.5  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  34.27 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  34.78 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  34.78 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  32.85 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  28 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  33.85 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  31.85 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0375  putative bile acid 7-alpha dehydratase  30.38 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  28.97 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  29.33 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  32.84 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  30.37 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7150  hypothetical protein  25.9 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  27.94 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  33.08 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  31.25 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  29.32 
 
 		 135 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  29.32 
 
 		 135 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  31.85 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  29.93 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  24.26 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  26.22 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  26.03 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  25.58 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  26.19 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  31.88 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  26.19 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  26.19 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  25.87 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2896  hypothetical protein  27.27 
 
 		 175 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  30.83 
 
 		 181 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  28.19 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>