More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0068 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0068  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  100 
 
 
368 aa  718    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1737  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.9 
 
 
370 aa  264  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0465543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  37.03 
 
 
387 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3373  chemotaxis-specific methylesterase  38.59 
 
 
381 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.46343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.11 
 
 
352 aa  215  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.02 
 
 
419 aa  212  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0523  chemotaxis-specific methylesterase  34.15 
 
 
425 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  36.86 
 
 
385 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.71 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4244  chemotaxis-specific methylesterase  36.02 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.11 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1812  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.26 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00552618  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1820  chemotaxis-specific methylesterase  34.85 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.353852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0878  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.5 
 
 
378 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1532  protein-glutamate methylesterase  37.26 
 
 
382 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  34.57 
 
 
393 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  38.35 
 
 
363 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3917  chemotaxis-specific methylesterase  36.17 
 
 
388 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.94 
 
 
379 aa  195  9e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3675  chemotaxis-specific methylesterase  35.2 
 
 
385 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338867  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.06 
 
 
386 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1711  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.26 
 
 
382 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.86 
 
 
371 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  37.22 
 
 
363 aa  193  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.02 
 
 
357 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1694  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.62 
 
 
389 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.02 
 
 
354 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  36.29 
 
 
356 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.9 
 
 
355 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  33.99 
 
 
344 aa  189  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  34.75 
 
 
381 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  33.71 
 
 
344 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  36.69 
 
 
363 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  36.8 
 
 
354 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  36.83 
 
 
349 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  37.18 
 
 
352 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  36.92 
 
 
355 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  35.97 
 
 
360 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4032  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.77 
 
 
405 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.688715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  35.97 
 
 
363 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  36.69 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  35.65 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.76 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.13 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  34.99 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.93 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  37.01 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  34.99 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  35.76 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  35.65 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  39.02 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2214  protein-glutamate methylesterase  35.07 
 
 
371 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0781  chemotaxis-specific methylesterase  35.1 
 
 
358 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  35.84 
 
 
359 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  36.94 
 
 
363 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1373  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.03 
 
 
356 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2484  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.75 
 
 
356 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.900562  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.74 
 
 
365 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  36.69 
 
 
350 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  36.13 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2580  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.75 
 
 
356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.1 
 
 
360 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0209  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase  37.86 
 
 
354 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.39 
 
 
340 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  33.43 
 
 
362 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.46 
 
 
370 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  34.67 
 
 
364 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  34.67 
 
 
364 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  34.67 
 
 
364 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  34.67 
 
 
364 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.93 
 
 
355 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.15 
 
 
362 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  37.46 
 
 
353 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  34.67 
 
 
364 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.19 
 
 
365 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  34.67 
 
 
364 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  36.59 
 
 
349 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  36.24 
 
 
349 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  36.24 
 
 
349 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  36.13 
 
 
349 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  35.26 
 
 
364 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  36.13 
 
 
349 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  36.24 
 
 
349 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  35.25 
 
 
360 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  36.24 
 
 
349 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.14 
 
 
351 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  35.25 
 
 
360 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  35.25 
 
 
360 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  36.24 
 
 
349 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1611  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.04 
 
 
356 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  34.39 
 
 
348 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  36.24 
 
 
349 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  36.13 
 
 
349 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  32.95 
 
 
344 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.96 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  35.85 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3102  dethiobiotin synthase  32.66 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.14 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  35.96 
 
 
349 aa  180  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  35.8 
 
 
362 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>