42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12080  predicted Na+-dependent transporter  100 
 
 		 278 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  63.47 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3238  bile acid:sodium symporter  50 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  43.23 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0110  sodium symporter  34.48 
 
 		 292 aa  158  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1482  bile acid:sodium symporter  31.29 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  31.52 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06350  predicted Na+-dependent transporter  34.92 
 
 		 310 aa  92  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  30.48 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  30.86 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2757  bile acid transporter family protein  29.3 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  30.21 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  27.24 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  28.24 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  28.21 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  26.07 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  27.65 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  26.77 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  27.65 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  27.65 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  24.67 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  27.06 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  24.58 
 
 		 321 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  23.11 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2168  bile acid--sodium symporter  30.13 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4532  bile acid/sodium symporter  29.66 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  30.46 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  25.44 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  27.92 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  23.33 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  27.33 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  22.69 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  27.27 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  27.75 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  32.35 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  29.69 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  25.41 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  21.99 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  23.11 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  26.62 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  26.17 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  29.17 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>