129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  34.62 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  32.69 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  32.69 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  34 
 
 
289 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  32.05 
 
 
289 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  33.21 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  32.5 
 
 
262 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  30.6 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  30.6 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  30.6 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  33.83 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  31.06 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  32.37 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  30.71 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  33.99 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  30.4 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  30.4 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  30.4 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  33.05 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  30.61 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  35.12 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  27.94 
 
 
284 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  27.94 
 
 
284 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  27.94 
 
 
284 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  30.42 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  30.2 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  30.2 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  30.77 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  30.92 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  31.92 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  30.92 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  30.92 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  30.24 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  30.24 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  31.58 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  32.65 
 
 
424 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  30.07 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  30.77 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  30.77 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  29.51 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  30.7 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  29.96 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  31.85 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  31.58 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  32.73 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  27.73 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  30.04 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  27.73 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  27.73 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  27.94 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  33.09 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  32.56 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  29.51 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  32.25 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  27.6 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  29.1 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  31.53 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  29.41 
 
 
374 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  30.6 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  27 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  28.7 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  28.4 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  28.97 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  28.97 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  28.26 
 
 
289 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  28.4 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  28.06 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  34.2 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  27.95 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  26.59 
 
 
279 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  29.39 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  29.93 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  29.45 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  29.03 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  31.98 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  32.14 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  31.73 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  30.77 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  28.36 
 
 
319 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  28.28 
 
 
285 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  31.85 
 
 
335 aa  56.2  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  28.33 
 
 
328 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  25.73 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  25.73 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  25.73 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  27.24 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  30.47 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  27.47 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  27.47 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  28.85 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  33.85 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  30.42 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  31.32 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  28.98 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  28.67 
 
 
305 aa  52.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  37.8 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21980  hypothetical protein  29.82 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0068  hypothetical protein  32.97 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  25.55 
 
 
329 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>