More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0293 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0293  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021896  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  80.85 
 
 		 141 aa  242  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  78.01 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  78.01 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  78.01 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  78.01 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0041  50S ribosomal protein L16  76.6 
 
 		 141 aa  230  6e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.123597  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1770  50S ribosomal protein L16  77.3 
 
 		 141 aa  228  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000306557  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1026  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 141 aa  226  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00185253  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0091  50S ribosomal protein L16  70.21 
 
 		 141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.453795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 		 140 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0496  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000877255  hitchhiker  0.00385796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  64.66 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0491  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00452  50S ribosomal protein L16  65.41 
 
 		 136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0232467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 140 aa  179  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 137 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0401  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0376  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  62.59 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0302  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00320104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0165  50S ribosomal protein L16  64.66 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000800282  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00737  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001735  LSU ribosomal protein L16p (L10e)  61.76 
 
 		 136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0191  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 		 136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000239067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  62.88 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0433  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 137 aa  176  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574852  hitchhiker  0.0000247561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0155  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  176  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000013379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  62.88 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0177  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  176  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2167  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 136 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000412231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0327  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 136 aa  175  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000295305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0476  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 136 aa  174  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0462501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0220  50S ribosomal protein L16  64.39 
 
 		 136 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000896692  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2317  50S ribosomal protein L16  61.65 
 
 		 137 aa  173  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0179145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0726  50S ribosomal protein L16  62.88 
 
 		 137 aa  173  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00162053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  60.61 
 
 		 137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1758  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.160083  normal  0.394515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  57.55 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000097682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000419502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0412  ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0307436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159558  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3800  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0333969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3702  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3629  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183832  normal  0.899526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  61.65 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000221172  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3629  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000850628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3744  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000101532  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  57.55 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3737  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980625  normal  0.023864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  62.79 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03164  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00234681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0400  ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422385  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3698  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3796  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000688504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  57.89 
 
 		 137 aa  170  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000439211  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03115  hypothetical protein  63.16 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00186538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3507  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143497  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3608  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  normal  0.0156267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4636  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000060598  normal  0.151194 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0400  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.0000683618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 151 aa  170  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0667  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 137 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00972373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3908  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 136 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000657151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0591  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 136 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146592  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0290  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 136 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000162666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  60.61 
 
 		 137 aa  167  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 144 aa  167  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  58.65 
 
 		 144 aa  167  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  58.65 
 
 		 144 aa  167  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4310  50S ribosomal protein L16  64.66 
 
 		 136 aa  167  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000402503  unclonable  0.0000000000462981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  59.09 
 
 		 137 aa  166  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 137 aa  166  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  58.27 
 
 		 141 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2365  50S ribosomal protein L16  62.02 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  61.65 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  61.65 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  58.39 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  56.83 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>