116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0035 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0035  cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 123 aa  238  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0641  inner membrane protein  41.8 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1381  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  40.34 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2244  membrane protein-like protein  40.48 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0054372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01067  membrane protein-like protein  40.83 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  37.61 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002528  hypothetical protein  38.33 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03488  hypothetical protein  40.78 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0353  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0493  hypothetical protein  36.13 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  33.6 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2147  putative integral membrane protein  39.2 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.864762  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5610  SNARE associated Golgi protein  39.32 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  33.6 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3229  transmembrane protein  36.89 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0020  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  33.6 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0345  hypothetical protein  36.29 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141714  hitchhiker  0.00000000000399194 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3614  membrane protein-like protein  36.44 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28510  hypothetical protein  38.21 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2487  hypothetical protein  37.82 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3548  membrane protein-like protein  35.59 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  36.89 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  35.45 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  37.6 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0088  hypothetical protein  40.5 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1001  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2534  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000278761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  35 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  36.29 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4069  membrane protein-like  36.67 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4297  membrane protein-like protein  36.67 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  36.67 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3220  membrane protein-like protein  36.67 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3715  membrane protein-like protein  35 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0487  putative transmembrane protein  33.07 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.528398  normal  0.0272623 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4193  membrane protein-like protein  35 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1327  hypothetical protein  39.83 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0199997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  34.96 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0190  uncharacterized membrane-associated protein  33.61 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2259  transmembrane protein  30 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.867153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0381  SNARE associated Golgi protein  31.36 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0933  transmembrane protein  32.5 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.590035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5166  membrane protein  38.26 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3169  hypothetical protein  34.48 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0441375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2017  hypothetical protein  36.13 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0715199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1466  hypothetical protein  34.45 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2237  membrane protein-like protein  30 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.564662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1070  hypothetical protein  35.94 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3187  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000058062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3935  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.809511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02544  conserved inner membrane protein  33.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0995  conserved hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000205167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3208  hypothetical protein  35.9 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000592602  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3361  hypothetical protein  32.8 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02509  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0129195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3235  hypothetical protein  34.4 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000052813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2825  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2972  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000189151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0892  hypothetical protein  34.4 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000438982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3370  hypothetical protein  34.4 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000974791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1018  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0859423  hitchhiker  0.00416875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2811  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000161283  hitchhiker  0.000505734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.323612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0846  hypothetical protein  34.15 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797425  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1119  hypothetical protein  34.15 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000563823  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3029  hypothetical protein  30.47 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332295 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3649  membrane protein-like protein  33 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1561  hypothetical protein  29.08 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0986  hypothetical protein  34.71 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000995466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0287  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1034  hypothetical protein  36.44 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  33.94 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3021  hypothetical protein  33.63 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0161641  hitchhiker  0.00000846709 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3004  hypothetical protein  33.63 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.055399  hitchhiker  0.00004287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2969  hypothetical protein  33.63 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0101702  hitchhiker  0.00077012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2938  hypothetical protein  33.63 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000195475  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2638  putative inner membrane protein  33.61 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1129  hypothetical protein  32.8 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0566076  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3328  SNARE associated Golgi protein  36.44 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0692  hypothetical protein  36.44 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0892  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4122  putative inner membrane protein  30.58 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  36.04 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0535  putative transmembrane protein  32 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1779  SNARE associated Golgi protein  32.71 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.380295  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1056  hypothetical protein  33.87 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1130  hypothetical protein  36.21 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4633  hypothetical protein  30.88 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3064  hypothetical protein  34.75 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2405  hypothetical protein  30.33 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1029  hypothetical protein  37.61 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1096  hypothetical protein  35.34 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3128  hypothetical protein  32.74 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  normal  0.0197186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3162  hypothetical protein  36.13 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0328  putative transmembrane protein  29.33 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3262  hypothetical protein  36.75 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.175834  normal  0.086413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3878  hypothetical protein  29.06 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0343  hypothetical protein  28 
 
 		 193 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.477555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>