More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0603 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  100 
 
 
397 aa  799    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  42.75 
 
 
406 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  42.71 
 
 
395 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  39.53 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  41.49 
 
 
399 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  40.84 
 
 
388 aa  269  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  39.69 
 
 
380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  35.09 
 
 
403 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  40.75 
 
 
395 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  37.62 
 
 
419 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  32.64 
 
 
411 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  32.21 
 
 
408 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  32.38 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  34.75 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  31.33 
 
 
411 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  35.73 
 
 
404 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  35.16 
 
 
404 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  36.36 
 
 
398 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  35.16 
 
 
404 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  34.87 
 
 
404 aa  206  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  35.73 
 
 
404 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  35.73 
 
 
404 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  35.73 
 
 
404 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  35.73 
 
 
404 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  35.59 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  35.59 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  35.59 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  36.36 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.66 
 
 
411 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.42 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  33.15 
 
 
387 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.85 
 
 
420 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  34.72 
 
 
402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.51 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.85 
 
 
392 aa  196  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  29.53 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.07 
 
 
399 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.42 
 
 
405 aa  192  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  35.88 
 
 
412 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  33.25 
 
 
409 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  35.39 
 
 
428 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  33.16 
 
 
434 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  35.12 
 
 
427 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  35.12 
 
 
427 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  35.12 
 
 
427 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  34.82 
 
 
405 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  34.82 
 
 
405 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4845  cytochrome P450  36.43 
 
 
405 aa  186  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  34.82 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  35.66 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  33.16 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  37.04 
 
 
395 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  34.25 
 
 
417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  34.55 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  34.28 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  33.79 
 
 
402 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.25 
 
 
408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  36.04 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  35.68 
 
 
406 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  36.62 
 
 
415 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.1 
 
 
406 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  35.66 
 
 
387 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.24 
 
 
411 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  34.1 
 
 
412 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  34.32 
 
 
433 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  32.47 
 
 
395 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  34.24 
 
 
399 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  33.85 
 
 
414 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  34.41 
 
 
402 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  32.15 
 
 
408 aa  176  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  34.73 
 
 
427 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  34.63 
 
 
396 aa  176  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  34.24 
 
 
400 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  32.96 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  32.82 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  34.71 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  33.06 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  32.96 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  32.96 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  32.82 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.69 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  32.9 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  34.46 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  31.2 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  31.15 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  31.15 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  31.14 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  32.61 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  33.7 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  31.69 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.06 
 
 
400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  33.33 
 
 
400 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  33.33 
 
 
400 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  33.51 
 
 
400 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.42 
 
 
411 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.42 
 
 
411 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  35.14 
 
 
404 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  33.42 
 
 
436 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  34.83 
 
 
414 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  36.13 
 
 
404 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>