More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0416 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  96.73 
 
 		 490 aa  827    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 490 aa  937    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.37 
 
 		 506 aa  581  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.24 
 
 		 515 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.71 
 
 		 491 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.45 
 
 		 491 aa  554  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  61.04 
 
 		 487 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.61 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  63.45 
 
 		 488 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  58.97 
 
 		 494 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  57.26 
 
 		 488 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.08 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  59.38 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.08 
 
 		 486 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.05 
 
 		 480 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.14 
 
 		 481 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.25 
 
 		 507 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.46 
 
 		 518 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.89 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  55.81 
 
 		 502 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  53.5 
 
 		 493 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.35 
 
 		 521 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.12 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.55 
 
 		 463 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.61 
 
 		 484 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.12 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.36 
 
 		 483 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.94 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.46 
 
 		 470 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  55.35 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.21 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.21 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.59 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.21 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.37 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  47.88 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.25 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.56 
 
 		 496 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.27 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.03 
 
 		 456 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.05 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.45 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.85 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.03 
 
 		 460 aa  296  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.43 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.81 
 
 		 440 aa  293  6e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.79 
 
 		 463 aa  292  1e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.63 
 
 		 433 aa  289  8e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  37.23 
 
 		 444 aa  289  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.16 
 
 		 466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.41 
 
 		 441 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.6 
 
 		 444 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.6 
 
 		 444 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  38.68 
 
 		 437 aa  282  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.95 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.78 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.58 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.66 
 
 		 471 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.73 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.17 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.31 
 
 		 429 aa  266  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.23 
 
 		 428 aa  262  8.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.41 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.62 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.22 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.82 
 
 		 442 aa  261  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  38.58 
 
 		 430 aa  261  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.83 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.96 
 
 		 482 aa  259  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.91 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.99 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.39 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.46 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.69 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.64 
 
 		 449 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  37.12 
 
 		 429 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  35.59 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.24 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  36.31 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4183  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.26 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.851751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2711  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.79 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.24 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.05 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.82 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.84 
 
 		 429 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.84 
 
 		 429 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.03 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.84 
 
 		 429 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  36.68 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.61 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.27 
 
 		 429 aa  249  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.75 
 
 		 467 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0817  xanthine/uracil permease family protein  38.96 
 
 		 433 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0804  xanthine/uracil permease family protein  38.74 
 
 		 433 aa  249  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4526  xanthine/uracil permease family protein  38.31 
 
 		 433 aa  249  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.190363 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0711  xanthine/uracil permease family protein  38.74 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000785311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0662  xanthine/uracil permease family protein  38.74 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0654  xanthine/uracil permease family protein  38.74 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000506416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0747  xanthine/uracil permease family protein  38.74 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.237802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0911  xanthine/uracil permease family protein  38.74 
 
 		 433 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>