195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2081 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  55.24 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  53.11 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  50.95 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  54.55 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  50.48 
 
 		 228 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  50.95 
 
 		 229 aa  207  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  51.76 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  48.1 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.31 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.04 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  48.74 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  46.67 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  46.67 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  47.5 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.81 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  45.37 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.19 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.26 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.89 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  46.08 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.4 
 
 		 222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.79 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.54 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  45.24 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.69 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  44.93 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.38 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  44.83 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.28 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  40.55 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  37.38 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.34 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.09 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.16 
 
 		 541 aa  151  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.3 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  42.23 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.94 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  36.32 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  36.79 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  35.85 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.76 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  37.93 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  36.32 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.02 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  39.7 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  39.3 
 
 		 227 aa  134  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.46 
 
 		 213 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  40.38 
 
 		 534 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  36.5 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  36.5 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  39.05 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  42.08 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  40.28 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  38.61 
 
 		 210 aa  128  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.94 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  39.05 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  40.1 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  37.5 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  39.51 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  39.81 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  39.44 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  38.66 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.58 
 
 		 451 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  37.86 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  37.98 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  37.36 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  38.35 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  40.39 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.96 
 
 		 520 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  38.14 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  37.86 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  38.92 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  38.57 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  37.67 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  39.32 
 
 		 209 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  37.67 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  42.49 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  33.96 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  35.18 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.27 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  34.91 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  36.95 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  38.05 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  38.61 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  38 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  39.58 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  39.11 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  38.61 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  40.1 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  35.58 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  35.21 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  36.46 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  37.5 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  35.19 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  37.5 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  37.82 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  37.09 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0630  precorrin-8X methylmutase  37.57 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.872392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  36.15 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>