More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8427 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  74.01 
 
 
191 aa  284  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  70 
 
 
197 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  59.44 
 
 
201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  60.1 
 
 
198 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  61.93 
 
 
198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  53.53 
 
 
188 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  53.53 
 
 
188 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  53.53 
 
 
188 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1144  conserved hypothetical protein 730  54.74 
 
 
216 aa  175  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263245  decreased coverage  0.00451054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  55.43 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  55.43 
 
 
181 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  51.46 
 
 
187 aa  168  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  51.18 
 
 
182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  51.69 
 
 
187 aa  161  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  45.45 
 
 
186 aa  158  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  45.16 
 
 
204 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  52.23 
 
 
185 aa  154  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  47.67 
 
 
180 aa  154  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  46.59 
 
 
191 aa  151  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  53.75 
 
 
187 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  47.49 
 
 
440 aa  147  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  51.66 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  50 
 
 
197 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  43.1 
 
 
190 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  50 
 
 
197 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  53.24 
 
 
207 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  49.01 
 
 
180 aa  137  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  41.42 
 
 
186 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  48.34 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  48.34 
 
 
184 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  47.4 
 
 
195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  47.4 
 
 
195 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  47.4 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  46.36 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  42.2 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  41.71 
 
 
180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  45.7 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  45.75 
 
 
193 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  41.81 
 
 
193 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  41.81 
 
 
193 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  41.81 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  44.72 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  46.36 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  45.62 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  41.14 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  44.52 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  40.11 
 
 
193 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  41.07 
 
 
180 aa  128  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  41.67 
 
 
200 aa  127  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  45.81 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  45.7 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  42.94 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  41.18 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  46.71 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  47.77 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  39.64 
 
 
198 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  42.77 
 
 
211 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  42.24 
 
 
194 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  42.86 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  42.24 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  41.67 
 
 
197 aa  124  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  44.52 
 
 
197 aa  124  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  39.78 
 
 
195 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  39.31 
 
 
194 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  41.32 
 
 
184 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  42.01 
 
 
207 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  45.81 
 
 
192 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  42.24 
 
 
194 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  41.61 
 
 
195 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1151  hypothetical protein  41.46 
 
 
182 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  42.01 
 
 
199 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  37.84 
 
 
201 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  47.74 
 
 
193 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  39.89 
 
 
188 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  41.11 
 
 
195 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  37.43 
 
 
201 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  41.11 
 
 
195 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1876  hypothetical protein  46.5 
 
 
208 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1797  hypothetical protein  46.5 
 
 
193 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  40.99 
 
 
193 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  46.36 
 
 
203 aa  120  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  37.7 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  42.11 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  40.57 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  40.56 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  39.57 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  40.99 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  40.99 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  40.99 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  40.99 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  42.31 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  40.99 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  39.88 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  40.99 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  40.37 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  42.58 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>