132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7366 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  65.07 
 
 
304 aa  346  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  50.36 
 
 
326 aa  231  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.52 
 
 
553 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.15 
 
 
550 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  43.32 
 
 
357 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  44.4 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.48 
 
 
297 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.26 
 
 
472 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.83 
 
 
275 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4496  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.14 
 
 
329 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.57 
 
 
465 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.19 
 
 
471 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.08 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.08 
 
 
330 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0314282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3840  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.08 
 
 
333 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.34 
 
 
365 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.31 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  30.4 
 
 
534 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  28.15 
 
 
443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  30.22 
 
 
368 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.68 
 
 
418 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  29.1 
 
 
349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  28.36 
 
 
337 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  30.22 
 
 
365 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  27.99 
 
 
337 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  27.24 
 
 
359 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0439  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.61 
 
 
298 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30181  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0474  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.61 
 
 
298 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.72 
 
 
416 aa  99.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  26.12 
 
 
379 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  26.12 
 
 
400 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  25.37 
 
 
401 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.92 
 
 
410 aa  96.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  25.56 
 
 
375 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  26.87 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.74 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.5 
 
 
309 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  29.48 
 
 
520 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3738  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.34 
 
 
304 aa  89  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.55 
 
 
410 aa  88.6  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.91 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.92 
 
 
408 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  31.09 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.81 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0278734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1692  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.38 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2778  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.37 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.0351721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.63 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.48 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.32 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.53 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.37 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  21.56 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.5 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.23 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  20.07 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  20.9 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.56 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  19.7 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  19.74 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  19.7 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  20.07 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.35 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  20.17 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  20.17 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  19.4 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  19.74 
 
 
236 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  20.17 
 
 
236 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.99 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  27.9 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.88 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  27.88 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  19.33 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  19.31 
 
 
236 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  19.74 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.18 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  19.74 
 
 
236 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  19.74 
 
 
236 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.22 
 
 
247 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.12 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0938  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.8 
 
 
126 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  19.7 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.71 
 
 
140 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.89 
 
 
122 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.13 
 
 
127 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.35 
 
 
127 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  30.71 
 
 
127 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.64 
 
 
127 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.58 
 
 
121 aa  58.9  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2795  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.63 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.048407  hitchhiker  0.00112635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 
127 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.56 
 
 
127 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.23 
 
 
127 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.99 
 
 
234 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  25.83 
 
 
142 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2921  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.13 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.03619  normal  0.0371299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.61 
 
 
234 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.61 
 
 
234 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2078  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.71 
 
 
238 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>