178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6072 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  100 
 
 
167 aa  321  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  81.44 
 
 
185 aa  257  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  75 
 
 
187 aa  238  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  67.26 
 
 
177 aa  213  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  71.43 
 
 
177 aa  208  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  66.05 
 
 
184 aa  183  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  62.5 
 
 
168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  63.29 
 
 
172 aa  179  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  61.96 
 
 
176 aa  177  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  60.49 
 
 
186 aa  177  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  61.94 
 
 
175 aa  177  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  62.2 
 
 
180 aa  176  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  64.05 
 
 
168 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  60.25 
 
 
188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  60.49 
 
 
185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  57.67 
 
 
178 aa  158  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  58.86 
 
 
184 aa  158  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  53.66 
 
 
164 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  53.37 
 
 
171 aa  154  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  55.03 
 
 
161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  50.31 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
184 aa  143  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  51.59 
 
 
159 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  51.59 
 
 
159 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  51.59 
 
 
159 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  54.36 
 
 
161 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  50.96 
 
 
161 aa  141  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  52.2 
 
 
234 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  51.32 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  54.12 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  52.29 
 
 
172 aa  130  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  53.42 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  50.31 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  52.15 
 
 
162 aa  125  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  50.32 
 
 
172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  43.92 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  51.83 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  43.54 
 
 
150 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  44.37 
 
 
152 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  44.59 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  46.85 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  42.36 
 
 
200 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  33.33 
 
 
150 aa  103  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  42.25 
 
 
152 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
153 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  42.04 
 
 
151 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  33.76 
 
 
149 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  40.85 
 
 
153 aa  101  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  30.77 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  30.77 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  99.8  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  32.91 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  38.89 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  32.72 
 
 
150 aa  98.6  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  34.97 
 
 
150 aa  97.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  31.21 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  41.55 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  32.91 
 
 
152 aa  92  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  42.96 
 
 
160 aa  92.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  32.91 
 
 
152 aa  92  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  39.44 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  42.25 
 
 
148 aa  88.6  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  36.55 
 
 
145 aa  87.8  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  29.49 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  32.88 
 
 
149 aa  85.9  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  33.33 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  33.76 
 
 
153 aa  84.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  39.44 
 
 
148 aa  84.3  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  35.44 
 
 
149 aa  84  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  33.54 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  38.73 
 
 
148 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  39.44 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  28.85 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  28.85 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  28.85 
 
 
149 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  28.85 
 
 
149 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  37.14 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  35.95 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  39.71 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  34.42 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  34.62 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  35.97 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  35.51 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1600  ArgR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  31.69 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0446  ArgR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>