23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1607 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  500  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  36.02 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  40.33 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  32.85 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  29.63 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  39.23 
 
 		 524 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  34.83 
 
 		 464 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  32.09 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  29.35 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  28.02 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  29.03 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  31.47 
 
 		 751 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  38.66 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  29.02 
 
 		 351 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  27.57 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  27.81 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 		 513 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18270  hypothetical protein  27.1 
 
 		 334 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  30.11 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26890  hypothetical protein  26.34 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  25.4 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2740  hypothetical protein  26.7 
 
 		 374 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  27.74 
 
 		 856 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>