8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26890  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2740  hypothetical protein  42.38 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  39.83 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  34.93 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18270  hypothetical protein  32.11 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  25.25 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  25.89 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  24.91 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>