11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3720 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26890  hypothetical protein  39.83 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2740  hypothetical protein  42.58 
 
 		 374 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  32.3 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18270  hypothetical protein  29.68 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  29.41 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  27.84 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  28.04 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  30.14 
 
 		 751 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  30.6 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  24.34 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>