21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6886 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  31.98 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  32.85 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  33.71 
 
 		 205 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  33.88 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.31 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  35.82 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  31.18 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  29.15 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  32.39 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  32.11 
 
 		 751 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  31.97 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  31.55 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  26.09 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26890  hypothetical protein  24.91 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  31.5 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  30.16 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  25.77 
 
 		 282 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  29.13 
 
 		 856 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>