16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4877 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  100 
 
 		 856 aa  1663    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  37.5 
 
 		 308 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  34.64 
 
 		 347 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.23 
 
 		 513 aa  107  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  41.8 
 
 		 751 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  32.62 
 
 		 231 aa  101  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  35.94 
 
 		 246 aa  101  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  40.38 
 
 		 281 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  32.07 
 
 		 256 aa  72  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  29.44 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  31.67 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  31.36 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  32.62 
 
 		 205 aa  63.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  32.7 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4519  hypothetical protein  30.15 
 
 		 239 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  36.84 
 
 		 241 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>