14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5505 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  474  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  29.41 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  39.23 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  32.24 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  34.21 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  39.02 
 
 
464 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  36.84 
 
 
856 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  35.9 
 
 
524 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  31.5 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  33.93 
 
 
751 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  31.3 
 
 
351 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  35.29 
 
 
347 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  33.67 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.63 
 
 
513 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>