24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1992 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  47.47 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  40.34 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  40.33 
 
 
247 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  36.93 
 
 
464 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  34.27 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  33.88 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  31.61 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  28.72 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  38.52 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  32.58 
 
 
524 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  31.15 
 
 
347 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  32.7 
 
 
856 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  31.47 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18270  hypothetical protein  31.6 
 
 
334 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  31.91 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  29.79 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  29.19 
 
 
282 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.1 
 
 
513 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  35.39 
 
 
281 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  32.5 
 
 
751 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2740  hypothetical protein  26.92 
 
 
374 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3954  hypothetical protein  40.54 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  28.02 
 
 
351 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>