17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1166 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  33.33 
 
 
751 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  33.51 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  29.35 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  32.06 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  30.33 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  31.73 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  27.96 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  28.4 
 
 
308 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  25.59 
 
 
256 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  28.4 
 
 
347 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  27.54 
 
 
464 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  25.13 
 
 
351 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  26.41 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  25.95 
 
 
524 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  24.06 
 
 
231 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  24.82 
 
 
856 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>