15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0633 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  420  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  32.29 
 
 
524 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  32.09 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  32.5 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  40 
 
 
751 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  31.47 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  30.21 
 
 
246 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  30.57 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  29.95 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  30.09 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  32.35 
 
 
347 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  33.1 
 
 
308 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  32.39 
 
 
258 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  27.14 
 
 
256 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  25.79 
 
 
283 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>