33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0075 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  55.23 
 
 		 756 aa  815    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  58.74 
 
 		 751 aa  868    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  59.97 
 
 		 769 aa  895    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  52.41 
 
 		 755 aa  769    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  54.94 
 
 		 751 aa  819    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  100 
 
 		 745 aa  1536    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  55.75 
 
 		 750 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  30.21 
 
 		 324 aa  104  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.39 
 
 		 325 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  26.33 
 
 		 326 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.14 
 
 		 327 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  23.8 
 
 		 322 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  26.65 
 
 		 359 aa  90.5  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.58 
 
 		 344 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.63 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  25.62 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.4 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  24.44 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.38 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  23.01 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  26.79 
 
 		 347 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  25.37 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  21.55 
 
 		 324 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  21.04 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6100  methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 364 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  25.17 
 
 		 335 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  21.73 
 
 		 339 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6509  hypothetical protein  27.63 
 
 		 364 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1320  hypothetical protein  27.63 
 
 		 364 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.472657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  24.51 
 
 		 373 aa  54.3  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  22.05 
 
 		 330 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5945  methyltransferase type 12  24.84 
 
 		 677 aa  47.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2610  hypothetical protein  25.68 
 
 		 295 aa  43.9  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>