120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2524 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
100 aa  212  2e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  58.76 
 
 
111 aa  120  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  61.29 
 
 
95 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  56.99 
 
 
95 aa  115  2e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  56.04 
 
 
96 aa  114  4e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  57.95 
 
 
97 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  58.43 
 
 
104 aa  112  1e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  56.18 
 
 
96 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  56.18 
 
 
96 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  53.61 
 
 
102 aa  109  1e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  55.68 
 
 
100 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  51.06 
 
 
95 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.13 
 
 
96 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  57.14 
 
 
96 aa  107  7e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  55.21 
 
 
118 aa  106  8e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  53.33 
 
 
95 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  52.22 
 
 
95 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 
95 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  53.76 
 
 
107 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  4.08802e-05  hitchhiker  5.27007e-05 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.69 
 
 
100 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.19 
 
 
95 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.22 
 
 
95 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.81 
 
 
96 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  58.14 
 
 
115 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.33 
 
 
95 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  51.09 
 
 
95 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 
120 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  52.94 
 
 
98 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  51.72 
 
 
110 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  49.47 
 
 
121 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  52.27 
 
 
125 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.33 
 
 
97 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  8.20325e-08  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  52.13 
 
 
101 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
113 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  49.46 
 
 
101 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  53.93 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  53.49 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 
95 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  44.09 
 
 
98 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  48.96 
 
 
114 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  47.83 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  52.94 
 
 
95 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  44.68 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  49.45 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  51.72 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  48.28 
 
 
118 aa  94  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  51.72 
 
 
107 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  48.28 
 
 
118 aa  93.6  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  48.28 
 
 
118 aa  93.6  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  45.65 
 
 
99 aa  93.2  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
95 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  45.16 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  49.41 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  46.51 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  41.76 
 
 
110 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  47.67 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  41.76 
 
 
99 aa  88.6  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  55.68 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  43.33 
 
 
95 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  49.4 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  48.91 
 
 
101 aa  84  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.43 
 
 
99 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  41.57 
 
 
113 aa  84  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.05 
 
 
96 aa  79.7  1e-14  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  40.62 
 
 
100 aa  79.3  2e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  55 
 
 
67 aa  74.3  5e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  73.9  6e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 
141 aa  59.7  1e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  43.06 
 
 
80 aa  58.5  3e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  38.75 
 
 
93 aa  58.5  3e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
108 aa  56.2  1e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.5 
 
 
98 aa  55.1  3e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  39.47 
 
 
83 aa  53.9  6e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.68 
 
 
151 aa  53.1  1e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2225  hypothetical protein  40.32 
 
 
116 aa  52.4  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  37.65 
 
 
97 aa  50.4  8e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
180 aa  49.7  1e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  35.53 
 
 
137 aa  49.7  1e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  36.47 
 
 
96 aa  48.9  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  35.63 
 
 
107 aa  48.5  3e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30 
 
 
104 aa  47.8  6e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  29.21 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.752306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.91 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  36 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3553  GIY-YIG nuclease superfamily protein  31.58 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.158193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00714  hypothetical protein  57.58 
 
 
37 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>