More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1939 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  94.61 
 
 
334 aa  643  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
334 aa  671  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  94.91 
 
 
334 aa  646  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  94.31 
 
 
334 aa  635  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  94.61 
 
 
334 aa  637  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  95.21 
 
 
334 aa  648  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  7.44022e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  94.31 
 
 
334 aa  638  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  94.61 
 
 
334 aa  639  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.2467e-05  hitchhiker  4.32146e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  94.91 
 
 
334 aa  646  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  4.99721e-05  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  88.92 
 
 
336 aa  611  1e-174  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  89.82 
 
 
334 aa  604  1e-172  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  88.43 
 
 
337 aa  602  1e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  88.06 
 
 
337 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  86.94 
 
 
338 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  86.94 
 
 
338 aa  588  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  87.13 
 
 
337 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.22 
 
 
337 aa  535  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.44 
 
 
336 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.84 
 
 
334 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  5.54774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.25 
 
 
336 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.31 
 
 
336 aa  529  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.96 
 
 
335 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  3.68947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.25 
 
 
336 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.01 
 
 
336 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.14 
 
 
334 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.25 
 
 
336 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.14 
 
 
334 aa  528  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.25 
 
 
336 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.65 
 
 
336 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.15623e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  76.65 
 
 
336 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  76.65 
 
 
336 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.65 
 
 
336 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.65 
 
 
336 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.65 
 
 
336 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.65 
 
 
336 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.65 
 
 
336 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.25 
 
 
336 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.35 
 
 
336 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.65 
 
 
334 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.65 
 
 
334 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.59876e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.05 
 
 
334 aa  521  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.65 
 
 
334 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.75 
 
 
334 aa  514  1e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.80468e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.45 
 
 
334 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  76.05 
 
 
355 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.62975e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.85 
 
 
335 aa  505  1e-142  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.27 
 
 
343 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.65 
 
 
334 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.35 
 
 
345 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.81 
 
 
337 aa  493  1e-138  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.67 
 
 
344 aa  492  1e-138  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.57 
 
 
348 aa  491  1e-138  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.67 
 
 
352 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.27 
 
 
348 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.57 
 
 
348 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.88 
 
 
363 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.34 
 
 
352 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.64 
 
 
352 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.61912e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.67 
 
 
348 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.16 
 
 
357 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.14 
 
 
357 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.14 
 
 
357 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.37 
 
 
352 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.86 
 
 
350 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  70 
 
 
354 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.24 
 
 
353 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.12 
 
 
358 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  70 
 
 
355 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.46 
 
 
353 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.26 
 
 
341 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.12 
 
 
336 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.43 
 
 
336 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.34 
 
 
345 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.04 
 
 
351 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.88 
 
 
356 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.88 
 
 
356 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.88 
 
 
356 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.6 
 
 
356 aa  471  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.88 
 
 
356 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.88 
 
 
356 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.88 
 
 
356 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.88 
 
 
356 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.96 
 
 
347 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.47 
 
 
337 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.41 
 
 
355 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.88 
 
 
356 aa  470  1e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.21 
 
 
353 aa  469  1e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.29 
 
 
355 aa  469  1e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.09 
 
 
356 aa  466  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.09 
 
 
356 aa  466  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.09 
 
 
356 aa  466  1e-130  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  70 
 
 
354 aa  466  1e-130  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.91 
 
 
351 aa  466  1e-130  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.51 
 
 
338 aa  466  1e-130  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.69 
 
 
356 aa  467  1e-130  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  70 
 
 
355 aa  466  1e-130  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.38 
 
 
356 aa  467  1e-130  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.47 
 
 
354 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.61 
 
 
354 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0312  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.39 
 
 
335 aa  462  1e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.223853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>