172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4285 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  100 
 
 
255 aa  493  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  81.71 
 
 
253 aa  410  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  82.88 
 
 
257 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  82.88 
 
 
257 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  82.88 
 
 
257 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  82.88 
 
 
257 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  82.88 
 
 
257 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  82.88 
 
 
257 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  82.88 
 
 
257 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  82.88 
 
 
257 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  81.71 
 
 
257 aa  397  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  80.93 
 
 
257 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  80.93 
 
 
257 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  80.93 
 
 
257 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  80.93 
 
 
257 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  80.54 
 
 
257 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  41.07 
 
 
291 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  40.57 
 
 
291 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  40.31 
 
 
265 aa  176  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  36.64 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  37.5 
 
 
277 aa  168  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  39.3 
 
 
270 aa  167  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  39.77 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  36.95 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  38.25 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  37.45 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  38.55 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  38.08 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  37.7 
 
 
258 aa  161  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  38.37 
 
 
269 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  39.27 
 
 
275 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  35.17 
 
 
298 aa  155  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  35.64 
 
 
298 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  34.13 
 
 
298 aa  146  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  36.62 
 
 
289 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  37.4 
 
 
269 aa  145  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  32.69 
 
 
279 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  36.93 
 
 
252 aa  142  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  40.78 
 
 
262 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  33.59 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  34.62 
 
 
265 aa  133  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  37.2 
 
 
247 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  32.77 
 
 
300 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  42.24 
 
 
390 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  32.52 
 
 
232 aa  118  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  45.19 
 
 
188 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  32.91 
 
 
237 aa  98.6  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  30.96 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  32.02 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  31.14 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  28.63 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  30.77 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  33.06 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  35.16 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  30.65 
 
 
271 aa  88.6  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  31.05 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  30.32 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  29.2 
 
 
270 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  32.64 
 
 
245 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  32.64 
 
 
245 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  29.02 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  34.96 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  30.31 
 
 
270 aa  85.5  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  28.52 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  30.38 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  28.09 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  31.8 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  32.33 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  30.65 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  32 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  30.71 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  28.57 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  30.31 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  30.31 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  30.45 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  30.65 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  30.04 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  29.96 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  32.6 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  31.05 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  28.29 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  34.13 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  33.73 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  30.19 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  29.27 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  33.73 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  31.56 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  34.01 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  28.51 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  30.36 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  36.11 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  30.46 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  28.82 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  34.16 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  30.36 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  31.28 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  29.13 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  30.51 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  36.42 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  38.4 
 
 
125 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>