More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2799 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1088    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  48.07 
 
 
543 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  47.7 
 
 
556 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  47.7 
 
 
543 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  45.36 
 
 
544 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  45.36 
 
 
544 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  47.16 
 
 
560 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  46.19 
 
 
586 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  43.14 
 
 
560 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  40.87 
 
 
559 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  39.76 
 
 
581 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.47 
 
 
559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.84 
 
 
592 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  40.45 
 
 
581 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.93 
 
 
558 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.55 
 
 
584 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.92 
 
 
561 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  39.93 
 
 
568 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  40.41 
 
 
582 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  38.38 
 
 
582 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  40.04 
 
 
582 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.83 
 
 
501 aa  360  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  36.76 
 
 
591 aa  353  4e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.84 
 
 
559 aa  346  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.88 
 
 
501 aa  336  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.22 
 
 
561 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.45 
 
 
561 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  31.57 
 
 
558 aa  300  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.09 
 
 
563 aa  300  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  31.73 
 
 
560 aa  300  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  31.07 
 
 
561 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.15 
 
 
558 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  32.19 
 
 
557 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  31.54 
 
 
560 aa  296  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  33.46 
 
 
551 aa  293  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.75 
 
 
558 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  31.95 
 
 
565 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  33.33 
 
 
552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  30.43 
 
 
558 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.97 
 
 
556 aa  277  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.43 
 
 
558 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  28.55 
 
 
564 aa  270  5.9999999999999995e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.59 
 
 
559 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  34.92 
 
 
550 aa  266  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  32.54 
 
 
552 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  31.31 
 
 
557 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  29.03 
 
 
599 aa  264  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  32.34 
 
 
556 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.78 
 
 
555 aa  257  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  30.49 
 
 
562 aa  256  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.88 
 
 
559 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.14 
 
 
573 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.52 
 
 
547 aa  254  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  28.86 
 
 
558 aa  251  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.91 
 
 
554 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.87 
 
 
559 aa  248  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  29.68 
 
 
555 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  31.13 
 
 
578 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  31.7 
 
 
557 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  31.06 
 
 
582 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  33.96 
 
 
544 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  29.95 
 
 
547 aa  234  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  29.45 
 
 
563 aa  233  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5398  hypothetical protein  36.06 
 
 
538 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61189  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  32.39 
 
 
585 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.2 
 
 
557 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.67 
 
 
559 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.8 
 
 
551 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  31.29 
 
 
584 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  29.31 
 
 
561 aa  229  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  31.29 
 
 
561 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  31.01 
 
 
557 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  32.16 
 
 
652 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  29.07 
 
 
571 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.89 
 
 
552 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.68 
 
 
549 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.12 
 
 
557 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.76 
 
 
521 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  31.69 
 
 
542 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.83 
 
 
552 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  29.59 
 
 
565 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.85 
 
 
514 aa  223  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  29.59 
 
 
565 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.22 
 
 
534 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  29.65 
 
 
571 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.43 
 
 
504 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  33 
 
 
689 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  29.22 
 
 
559 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  30.09 
 
 
525 aa  218  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  31.78 
 
 
556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  31.13 
 
 
558 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5644  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
646 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588147  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.98 
 
 
509 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  26.97 
 
 
562 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  32.35 
 
 
560 aa  217  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  26.97 
 
 
562 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.75 
 
 
547 aa  217  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.72 
 
 
557 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  33.33 
 
 
619 aa  215  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.1 
 
 
558 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>