54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2257 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  53.49 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  33.16 
 
 		 210 aa  88.6  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  50.65 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  33.7 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  55.38 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  53.73 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  47.37 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  29.78 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  30.22 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  35.5 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  46.05 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  49.25 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  32.37 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  29.19 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  40.91 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  32.09 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  29.12 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  28.02 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  40.51 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  28.95 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  44.74 
 
 		 212 aa  50.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  44.93 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 186 aa  44.3  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  25.97 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 115 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 117 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 127 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  34.33 
 
 		 109 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  32.39 
 
 		 106 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 129 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 171 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  34.12 
 
 		 98 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 		 132 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 125 aa  40.8  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>