218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6456 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  100 
 
 		 402 aa  828    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  43.77 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  40.76 
 
 		 409 aa  312  5.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  41.43 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  42.78 
 
 		 449 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  42.2 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  41.67 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  38.52 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  40.21 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  40.37 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  39.1 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  40.37 
 
 		 413 aa  255  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  37.84 
 
 		 602 aa  251  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  41.42 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  40.83 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  36.55 
 
 		 431 aa  245  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  37.6 
 
 		 429 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  37.5 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  38.42 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  35.02 
 
 		 464 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  35.19 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  37.47 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  34.41 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  34.4 
 
 		 447 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  34.21 
 
 		 456 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  35.45 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  39.19 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  34.47 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  33.72 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  35.89 
 
 		 423 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  37.87 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  38.53 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  35.16 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  32.45 
 
 		 448 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  36.14 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  32.35 
 
 		 472 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  38.75 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  37.13 
 
 		 415 aa  206  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  33.77 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  35.36 
 
 		 412 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  33.78 
 
 		 333 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  35.62 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  32.97 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  34.12 
 
 		 363 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.42 
 
 		 307 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  34.05 
 
 		 419 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  31.67 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  31.13 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  32.6 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  30.3 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  32.52 
 
 		 315 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  30.55 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  28.42 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  29.74 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.48 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  30.69 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  30.1 
 
 		 323 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  30.1 
 
 		 323 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  29.3 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  29.52 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  27.92 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  29.77 
 
 		 323 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  30.1 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  31.58 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  30.1 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  29.77 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  27.64 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  30.36 
 
 		 320 aa  143  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  29.45 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  29.45 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  32.27 
 
 		 342 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  28.33 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  29.02 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  30.03 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  29.32 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  28.66 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  28.66 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  28.85 
 
 		 307 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  29.58 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  28.93 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  27.17 
 
 		 307 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  26.28 
 
 		 311 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  26.42 
 
 		 388 aa  133  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  29.11 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  27.03 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  28.42 
 
 		 307 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  30.23 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  27.52 
 
 		 390 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  26.89 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  27.42 
 
 		 307 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  29.69 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  29.12 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  25.81 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  32.24 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>