40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0553 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0553  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  357  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0554  hypothetical protein  95.4 
 
 		 174 aa  343  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3476  hypothetical protein  94.83 
 
 		 174 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0554  hypothetical protein  93.68 
 
 		 174 aa  340  7e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3320  hypothetical protein  87.93 
 
 		 174 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0513  hypothetical protein  86.21 
 
 		 174 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000397292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3755  hypothetical protein  85.63 
 
 		 174 aa  316  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000456164  normal  0.156287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3811  hypothetical protein  85.63 
 
 		 174 aa  316  9e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000267592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3937  hypothetical protein  85.06 
 
 		 174 aa  313  9e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0863886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0607  hypothetical protein  66.09 
 
 		 174 aa  250  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3725  hypothetical protein  62.64 
 
 		 174 aa  250  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4346  hypothetical protein  64.37 
 
 		 174 aa  247  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3154  hypothetical protein  61.49 
 
 		 174 aa  241  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3528  hypothetical protein  64.37 
 
 		 174 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0435  hypothetical protein  66.67 
 
 		 173 aa  237  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0662  hypothetical protein  57.87 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0781  hypothetical protein  44.94 
 
 		 178 aa  173  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.946509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3370  hypothetical protein  43.82 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  0.288498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03075  hypothetical protein  34.68 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01743  hypothetical protein  40.27 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00519538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0968  hypothetical protein  35.12 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0446  hypothetical protein  33.79 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3567  hypothetical protein  33.73 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00374365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0667  hypothetical protein  29.38 
 
 		 201 aa  85.1  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0825  hypothetical protein  32.18 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0410  hypothetical protein  28.48 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4423  hypothetical protein  37.27 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0940793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4887  hypothetical protein  37.27 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  0.873613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4237  hypothetical protein  30.91 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3197  hypothetical protein  26.99 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4933  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1980  hypothetical protein  28.47 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.27976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0340  hypothetical protein  26.63 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.844466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0329  hypothetical protein  26.63 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1711  hypothetical protein  31 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.495547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35440  hypothetical protein  26.14 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1816  hypothetical protein  29.91 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2052  hypothetical protein  32.73 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2802  hypothetical protein  26.06 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218116  normal  0.415128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1446  hypothetical protein  23.4 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>