281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3721 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  100 
 
 		 331 aa  681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  90.33 
 
 		 331 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  90 
 
 		 331 aa  620  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  90.03 
 
 		 331 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  90.03 
 
 		 331 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  89.73 
 
 		 331 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  89.09 
 
 		 331 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  88.48 
 
 		 331 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  87.88 
 
 		 331 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  88.18 
 
 		 331 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  87.31 
 
 		 331 aa  598  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  84.04 
 
 		 332 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  81.87 
 
 		 332 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  65.95 
 
 		 334 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  64.91 
 
 		 334 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  65.24 
 
 		 334 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  62.88 
 
 		 332 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  62.27 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  63.19 
 
 		 333 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  62.27 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  62.27 
 
 		 332 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  63.19 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  63.19 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  63.19 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  62.88 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  61.96 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  61.96 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  61.35 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  61.35 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  61.35 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  61.35 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  61.35 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  61.35 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  60.43 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  61.04 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  60.43 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  60.43 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  62.2 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  60 
 
 		 337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  55.45 
 
 		 331 aa  394  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  35.29 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  35.09 
 
 		 376 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  35.29 
 
 		 359 aa  192  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  34.78 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  34.78 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  34.78 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  34.46 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  32.75 
 
 		 354 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  32.82 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  32.72 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  29.54 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  33.73 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  30.56 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  29.66 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  32.53 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  30.58 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  29.72 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  31.1 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  32.63 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  29.94 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  29.63 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  32.08 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  30.75 
 
 		 336 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  30.93 
 
 		 364 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  32.64 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  32.1 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  32.65 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  32.65 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  32.65 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  32.73 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  35.48 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  33.63 
 
 		 362 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  31.95 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  30.84 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  30.3 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  30.65 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  27.36 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1320  adenosine deaminase  32.15 
 
 		 363 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0285514  normal  0.854573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  31.83 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  28.4 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  29.97 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3533  adenosine deaminase  31.85 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0451471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  30.12 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  32.12 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1162  adenosine deaminase  29.19 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  31.31 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0789  adenosine deaminase  31.86 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  30.86 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  31.72 
 
 		 364 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04960  adenosine deaminase  30.81 
 
 		 403 aa  145  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.567283  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  27.04 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  32.17 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13344  adenosine deaminase  31.75 
 
 		 365 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.359069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  31.29 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0976  adenosine deaminase  30.43 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  31.25 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1781  adenosine deaminase  31.59 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  32.35 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>