More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_03530  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  100 
 
 		 674 aa  1378    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.851007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1111  ATPase AAA-2 domain protein  38.54 
 
 		 639 aa  359  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.944563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2695  ATPase AAA-2 domain protein  33.44 
 
 		 608 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1418  ATPase AAA-2  35.29 
 
 		 607 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6411  ATPase  35.29 
 
 		 607 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5698  ATPase  35.14 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7071  ATPase  34.98 
 
 		 607 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28920  putative chaperone  34.76 
 
 		 627 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325759  hitchhiker  0.00000775064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2530  putative chaperone  34.49 
 
 		 609 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14960  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  34.83 
 
 		 632 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4603  ATPase  42.55 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.705883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3151  ATPase AAA-2  35.13 
 
 		 634 aa  244  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000310841  unclonable  0.0000497822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7789  chaperone clpB  41.45 
 
 		 876 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.510261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  45.85 
 
 		 862 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  39.93 
 
 		 813 aa  214  3.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  41.19 
 
 		 867 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  42.24 
 
 		 863 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  39.62 
 
 		 854 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3145  ATP-dependent chaperone ClpB  40.33 
 
 		 861 aa  210  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5181  ATP-dependent chaperone ClpB  40.26 
 
 		 854 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399892  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  37.7 
 
 		 862 aa  210  9e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  40.58 
 
 		 854 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  42.37 
 
 		 862 aa  209  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11960  ATP-dependent protease  40.67 
 
 		 854 aa  208  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  36.34 
 
 		 861 aa  207  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1850  ATP-dependent Clp protease subunit  40.53 
 
 		 861 aa  207  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.808048  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  44.66 
 
 		 859 aa  207  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5495  ATPase  39.22 
 
 		 902 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4545  ATP-dependent chaperone ClpB  38.63 
 
 		 854 aa  207  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1887  putative ATP-dependent Clp protease, ATP- binding subunit  38.7 
 
 		 961 aa  207  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135075  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4791  ATP-dependent chaperone ClpB  46.32 
 
 		 861 aa  207  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110133  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24612  chaperone, Hsp100 family, ClpB-type  42.75 
 
 		 923 aa  206  8e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.311804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1823  ATPase  40.53 
 
 		 860 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  40.46 
 
 		 854 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  40.07 
 
 		 865 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7086  ATPase  46.81 
 
 		 946 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355216  normal  0.126483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1549  putative ATP-dependent protease (heat shock protein)  39.8 
 
 		 867 aa  206  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  38.54 
 
 		 860 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  46.81 
 
 		 946 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  42.86 
 
 		 814 aa  206  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  46.81 
 
 		 946 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1779  ATP-dependent chaperone ClpB  40.53 
 
 		 861 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.772911  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0092  ATP-dependent chaperone protein ClpB  42.97 
 
 		 864 aa  206  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030598 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  40.79 
 
 		 949 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  42.28 
 
 		 855 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6417  ATPase  38.35 
 
 		 953 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.243039 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5668  ATPase  38.35 
 
 		 953 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0943  chaperone ClpB  38.63 
 
 		 857 aa  205  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000133749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4834  chaperone clpB  40.79 
 
 		 854 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0201945  normal  0.188995 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5411  ATPase  46.98 
 
 		 953 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0379558 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  42.59 
 
 		 859 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0876  ATPase  37.81 
 
 		 862 aa  204  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  39.2 
 
 		 862 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  37.7 
 
 		 858 aa  204  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  37.7 
 
 		 858 aa  204  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  38.99 
 
 		 859 aa  204  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6193  ATPase AAA-2 domain protein  43.38 
 
 		 930 aa  204  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02158  ATP-dependent chaperone ClpB  38.85 
 
 		 898 aa  204  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.46606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  40.13 
 
 		 872 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3639  ATPase  42.24 
 
 		 854 aa  203  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  37.74 
 
 		 865 aa  203  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  41.54 
 
 		 825 aa  203  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  40.98 
 
 		 875 aa  203  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3599  ATPase  37.7 
 
 		 867 aa  203  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  42.96 
 
 		 843 aa  203  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2015  ClpB  40 
 
 		 859 aa  203  9e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  41 
 
 		 862 aa  203  9e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_51134  predicted protein  41.64 
 
 		 887 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  41.82 
 
 		 855 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  43.59 
 
 		 841 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  44.83 
 
 		 864 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0243  ATP-dependent chaperone ClpB  44.22 
 
 		 861 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0179  ATP-dependent chaperone ClpB  40 
 
 		 859 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0711  protein disaggregating chaperone ClpB  42.59 
 
 		 857 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  38.27 
 
 		 859 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  39.69 
 
 		 872 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1002  ATP-dependent chaperone ClpB  39.43 
 
 		 859 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0453  ATP-dependent chaperone ClpB  39.02 
 
 		 867 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000117348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0671  ATP-dependent chaperone ClpB  46.93 
 
 		 854 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0447  ATPase  39.67 
 
 		 867 aa  201  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000333741  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0537  ATP-dependent chaperone protein ClpB  42.44 
 
 		 857 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.520479  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  42.12 
 
 		 859 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  47.81 
 
 		 871 aa  201  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  37.34 
 
 		 865 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  42.46 
 
 		 878 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  46.55 
 
 		 871 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  40.88 
 
 		 872 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  42.97 
 
 		 889 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0981  ATP-dependent chaperone ClpB  40.88 
 
 		 872 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  38.1 
 
 		 854 aa  201  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2550  ATP-dependent chaperone ClpB  38.1 
 
 		 867 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  39.4 
 
 		 857 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  42.22 
 
 		 842 aa  201  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3198  ATPase  38.1 
 
 		 867 aa  201  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6458  ATP-dependent chaperone ClpB  43.02 
 
 		 864 aa  201  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  40.13 
 
 		 870 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  41.64 
 
 		 873 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  38.75 
 
 		 852 aa  200  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4357  ATPase  39.67 
 
 		 866 aa  200  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0665  ATPase  46.49 
 
 		 854 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>