More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14960 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_14960  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  100 
 
 
632 aa  1291    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.426512  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2695  ATPase AAA-2 domain protein  35.67 
 
 
608 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5698  ATPase  36.93 
 
 
607 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2530  putative chaperone  36.57 
 
 
609 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28920  putative chaperone  36.1 
 
 
627 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325759  hitchhiker  0.00000775064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1111  ATPase AAA-2 domain protein  40.99 
 
 
639 aa  351  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.944563  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7071  ATPase  37.52 
 
 
607 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1418  ATPase AAA-2  37.6 
 
 
607 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6411  ATPase  37.6 
 
 
607 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3151  ATPase AAA-2  39.39 
 
 
634 aa  306  7e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000310841  unclonable  0.0000497822 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4603  ATPase  33.64 
 
 
624 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.705883  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03530  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  34.32 
 
 
674 aa  280  4e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.851007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  40.56 
 
 
867 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  39.71 
 
 
861 aa  228  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  38.5 
 
 
859 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  38.82 
 
 
861 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2032  ATP-dependent chaperone ClpB  37.37 
 
 
862 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705253  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6458  ATP-dependent chaperone ClpB  41.48 
 
 
864 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  38.21 
 
 
870 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  38.21 
 
 
870 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  40.13 
 
 
862 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  40.97 
 
 
846 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  37.29 
 
 
864 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  39.27 
 
 
850 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  37.91 
 
 
870 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  39.56 
 
 
815 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7789  chaperone clpB  37.15 
 
 
876 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.510261 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  42.72 
 
 
865 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  37.5 
 
 
876 aa  218  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  37.98 
 
 
862 aa  218  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  39.68 
 
 
837 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  37.2 
 
 
860 aa  217  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0886  protein disaggregation chaperone  39.49 
 
 
857 aa  217  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000176912  normal  0.0332416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2577  ATPase  39.31 
 
 
440 aa  217  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6943  ATP-dependent chaperone ClpB  38.89 
 
 
860 aa  217  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0092  ATP-dependent chaperone protein ClpB  35.53 
 
 
864 aa  217  5e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  40.06 
 
 
862 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  39.75 
 
 
865 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  37.58 
 
 
865 aa  216  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4861  ATP-dependent chaperone ClpB  40.91 
 
 
890 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  37.17 
 
 
872 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  39.68 
 
 
829 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  38.16 
 
 
792 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  39.31 
 
 
869 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  36.47 
 
 
894 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  39.87 
 
 
862 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  37.83 
 
 
792 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  38.19 
 
 
893 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  36.87 
 
 
872 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  38.77 
 
 
814 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2717  ATP-dependent chaperone ClpB  38.17 
 
 
859 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.901861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3106  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  39.43 
 
 
859 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652443  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  42.09 
 
 
865 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0234  ATP-dependent chaperone ClpB  39.41 
 
 
863 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40.26 
 
 
879 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  38.56 
 
 
865 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  37.94 
 
 
859 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  37.23 
 
 
875 aa  214  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  40.72 
 
 
810 aa  214  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  37.86 
 
 
871 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  38.18 
 
 
880 aa  214  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1823  ATPase  39.56 
 
 
860 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0876  ATPase  41.07 
 
 
862 aa  213  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  37.42 
 
 
820 aa  213  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  36.21 
 
 
864 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  39.94 
 
 
858 aa  213  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  37.93 
 
 
865 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  38.51 
 
 
869 aa  213  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3479  ATP-dependent chaperone ClpB  39.01 
 
 
880 aa  213  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  38.91 
 
 
889 aa  213  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  40.72 
 
 
830 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  38.28 
 
 
854 aa  212  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5193  ATP-dependent chaperone ClpB  39.74 
 
 
874 aa  212  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25856  predicted protein  38.56 
 
 
997 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  39.81 
 
 
811 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  37.75 
 
 
878 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  37.35 
 
 
891 aa  212  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3203  ATPase AAA-2 domain protein  38.59 
 
 
853 aa  212  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0815  ClpB protein  39.18 
 
 
859 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4582  ATP-dependent chaperone ClpB  35.96 
 
 
899 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.994728  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0085  ATP-dependent chaperone ClpB  39.03 
 
 
872 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.802904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  39.81 
 
 
839 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2646  ATP-dependent chaperone ClpB  40.57 
 
 
860 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  35.16 
 
 
859 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2015  ClpB  37.69 
 
 
859 aa  211  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0414  AAA ATPase  39.68 
 
 
854 aa  211  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.817995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2431  ATP-dependent chaperone ClpB  37.11 
 
 
865 aa  211  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.500769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3609  ATPase  37.54 
 
 
860 aa  211  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766935  normal  0.0261141 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  36.93 
 
 
818 aa  211  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  36.71 
 
 
863 aa  211  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2225  ATPase  40.45 
 
 
867 aa  211  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00451076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  38.96 
 
 
880 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38530  ATP-dependent chaperone ClpB  39.55 
 
 
873 aa  210  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2812  ATPase AAA-2 domain protein  36.99 
 
 
440 aa  210  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0179  ATP-dependent chaperone ClpB  37.69 
 
 
859 aa  211  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  36.8 
 
 
879 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  39.2 
 
 
871 aa  211  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2016  ATPase  38.99 
 
 
847 aa  211  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.551696  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4357  ATPase  40.32 
 
 
866 aa  210  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3145  ATP-dependent chaperone ClpB  37.46 
 
 
861 aa  210  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>