More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_7071 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2530  putative chaperone  74.01 
 
 		 609 aa  860    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7071  ATPase  100 
 
 		 607 aa  1209    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1418  ATPase AAA-2  98.85 
 
 		 607 aa  1196    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5698  ATPase  90.28 
 
 		 607 aa  1090    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28920  putative chaperone  73.51 
 
 		 627 aa  875    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325759  hitchhiker  0.00000775064 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6411  ATPase  98.85 
 
 		 607 aa  1196    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1111  ATPase AAA-2 domain protein  44.57 
 
 		 639 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.944563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2695  ATPase AAA-2 domain protein  42.19 
 
 		 608 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14960  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  37.94 
 
 		 632 aa  352  8.999999999999999e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03530  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  34.98 
 
 		 674 aa  322  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.851007 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4603  ATPase  36.27 
 
 		 624 aa  301  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.705883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3151  ATPase AAA-2  32.26 
 
 		 634 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000310841  unclonable  0.0000497822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  40.38 
 
 		 879 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  39.83 
 
 		 862 aa  228  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2815  ATPase  40.76 
 
 		 870 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565756  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  41.25 
 
 		 879 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  40.65 
 
 		 870 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  40.95 
 
 		 879 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0075  ATPase  40.65 
 
 		 870 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0715422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1502  ATPase AAA-2  27.29 
 
 		 597 aa  224  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.879409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  39.77 
 
 		 879 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6458  ATP-dependent chaperone ClpB  40.29 
 
 		 864 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  39.36 
 
 		 868 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1195  chaperone  39.49 
 
 		 879 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1608  ATPase AAA-2 domain protein  40.38 
 
 		 994 aa  220  6e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000771621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  40.29 
 
 		 891 aa  219  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0570  ATP-dependent chaperone ClpB  37.8 
 
 		 864 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.483614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  40.7 
 
 		 870 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  40.17 
 
 		 865 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0109  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  36.39 
 
 		 816 aa  219  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  40.65 
 
 		 854 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1828  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  37.36 
 
 		 815 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223086  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  36.89 
 
 		 789 aa  217  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  40.53 
 
 		 871 aa  216  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  39.47 
 
 		 878 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0583  ATP-dependent chaperone ClpB  37.95 
 
 		 862 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  39.76 
 
 		 855 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  40.06 
 
 		 837 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0666  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  35.73 
 
 		 816 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.483496  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  40.74 
 
 		 862 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  40.74 
 
 		 859 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4357  ATPase  41.19 
 
 		 866 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0130  ATPase AAA-2  41.69 
 
 		 872 aa  212  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  40.43 
 
 		 891 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  39.08 
 
 		 864 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  41.19 
 
 		 879 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  39.53 
 
 		 864 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  40.99 
 
 		 829 aa  211  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3128  ATPase  39.77 
 
 		 859 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  39.81 
 
 		 874 aa  211  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  36.02 
 
 		 867 aa  210  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  40.94 
 
 		 875 aa  209  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  40.06 
 
 		 874 aa  209  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  39.18 
 
 		 820 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  39.44 
 
 		 878 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  36.62 
 
 		 862 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  36.31 
 
 		 810 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  40.25 
 
 		 861 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1850  ATP-dependent Clp protease subunit  38.07 
 
 		 861 aa  209  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.808048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  40.24 
 
 		 866 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3813  ATP-dependent chaperone ClpB  40.43 
 
 		 866 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7789  chaperone clpB  37.94 
 
 		 876 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.510261 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  36.89 
 
 		 791 aa  209  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  35.08 
 
 		 858 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  35.08 
 
 		 858 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  37.53 
 
 		 823 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  40.06 
 
 		 871 aa  208  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  36.89 
 
 		 791 aa  208  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  38.04 
 
 		 812 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  39.51 
 
 		 874 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  40.43 
 
 		 880 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  39.17 
 
 		 859 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1039  ATPase  39.75 
 
 		 873 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.924654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  38.3 
 
 		 792 aa  207  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4070  ATPase  38.75 
 
 		 825 aa  207  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1797  ATP-dependent chaperone ClpB  40.06 
 
 		 931 aa  207  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287163  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  39.29 
 
 		 822 aa  207  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  39.16 
 
 		 878 aa  207  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2625  ATP-dependent chaperone ClpB  39.2 
 
 		 874 aa  207  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0502533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1077  ATPase  40.12 
 
 		 866 aa  207  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  39.2 
 
 		 874 aa  207  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1779  ATP-dependent chaperone ClpB  37.78 
 
 		 861 aa  206  8e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.772911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  36.95 
 
 		 806 aa  206  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  35.98 
 
 		 837 aa  206  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  38.25 
 
 		 865 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1287  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  39.51 
 
 		 866 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0645  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  38.44 
 
 		 857 aa  206  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0240  clpB protein  35.41 
 
 		 857 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000492438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  37.42 
 
 		 868 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1223  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  39.81 
 
 		 866 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  37.21 
 
 		 854 aa  206  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  37.96 
 
 		 862 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2027  ATP-dependent chaperone ClpB  38.21 
 
 		 860 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000180597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  37.69 
 
 		 792 aa  206  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  34.74 
 
 		 856 aa  206  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  39.51 
 
 		 866 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  40.4 
 
 		 818 aa  206  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  36.58 
 
 		 874 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  37.89 
 
 		 824 aa  205  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05550  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  37.57 
 
 		 865 aa  205  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>