More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1767 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  68.88 
 
 		 199 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  66.84 
 
 		 200 aa  277  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  66.84 
 
 		 200 aa  277  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  67.02 
 
 		 229 aa  272  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  60.2 
 
 		 201 aa  268  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  62.76 
 
 		 198 aa  262  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  61.42 
 
 		 201 aa  261  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  61.03 
 
 		 200 aa  256  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  58.88 
 
 		 198 aa  256  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  65.48 
 
 		 198 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  58.97 
 
 		 200 aa  254  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  60.2 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  60 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  59.49 
 
 		 209 aa  248  6e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  58.55 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  55.61 
 
 		 227 aa  245  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  57.14 
 
 		 200 aa  241  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  57.65 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  57.29 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  56.63 
 
 		 200 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  56.85 
 
 		 199 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  55.61 
 
 		 204 aa  237  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 199 aa  236  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  54.23 
 
 		 206 aa  235  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  55.73 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 199 aa  231  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  53.3 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  56.12 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  56.54 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  57.22 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  57.29 
 
 		 194 aa  229  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  52.79 
 
 		 199 aa  228  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  52.79 
 
 		 199 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  53.33 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  57.07 
 
 		 193 aa  228  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  56.78 
 
 		 199 aa  227  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  54.17 
 
 		 199 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  57.07 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  57.07 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  57.14 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  55.73 
 
 		 198 aa  224  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  56.28 
 
 		 194 aa  224  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  56.63 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  55.78 
 
 		 194 aa  224  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000374974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  56.35 
 
 		 193 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  56.57 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  55.33 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  54.4 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  55.56 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  56.35 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3219  Superoxide dismutase  54.31 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  53.81 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  56.57 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  54.4 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  53.81 
 
 		 192 aa  221  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1163  Superoxide dismutase  51.03 
 
 		 207 aa  221  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 193 aa  220  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 193 aa  220  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  56.63 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3212  manganese and iron superoxide dismutase  52.28 
 
 		 194 aa  219  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000662131  normal  0.274821 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  54.82 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  54.82 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 193 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  54.31 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000404322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  55.96 
 
 		 193 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 193 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  53.3 
 
 		 193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  54.04 
 
 		 194 aa  218  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  54.31 
 
 		 192 aa  218  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  53.54 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  53.54 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0966  Superoxide dismutase  54.4 
 
 		 200 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  53.54 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  53.54 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0822  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.600443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  53.54 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  53.54 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  53.54 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  53.54 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  53.54 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 194 aa  217  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  53.3 
 
 		 221 aa  217  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 194 aa  217  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  53.27 
 
 		 194 aa  217  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 194 aa  217  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 194 aa  217  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 194 aa  217  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  53.27 
 
 		 194 aa  217  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  55.44 
 
 		 193 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1558  Superoxide dismutase  53.3 
 
 		 193 aa  217  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25329  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  53.12 
 
 		 199 aa  217  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  54.4 
 
 		 200 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 194 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  52.79 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 192 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2568  superoxide dismutase  53.3 
 
 		 194 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28771  decreased coverage  0.00195196 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  53.03 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>