30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1258 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  337  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  26.43 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  28.24 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  48.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  36.67 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  37.88 
 
 		 287 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  27.85 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  26.8 
 
 		 134 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  27.85 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  27.85 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  31.71 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  31.4 
 
 		 180 aa  44.3  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  40.38 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  29.49 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  26.58 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  30 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  35.38 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  27.94 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  29.11 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  25.76 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  26.72 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  29.69 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  35.59 
 
 		 178 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  35.38 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  26.58 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  26.92 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  27.34 
 
 		 271 aa  41.2  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  41.2  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  26.36 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>