48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0218 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  36.95 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  36.65 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  37.35 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  35.91 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  36.04 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  34.64 
 
 		 327 aa  192  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  35.17 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  32.25 
 
 		 346 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  36.66 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  34.86 
 
 		 368 aa  175  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  30.84 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  33.63 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  32.64 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  36.13 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  34.65 
 
 		 344 aa  165  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  35.76 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  33.13 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  33.84 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  31.68 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  33.13 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  33.13 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  31.88 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  32.46 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  32.07 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  27.38 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  30.27 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  24.69 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  28.22 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  28.69 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  26.58 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  29.74 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  51.79 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  51.79 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  27.8 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  25.11 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  29.67 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5328  hypothetical protein  54 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  50.91 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  35 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  26.13 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  52 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  27.47 
 
 		 315 aa  49.7  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  26.34 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  26.34 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1969  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  41.54 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  41.07 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>