47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_4007 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  75 
 
 		 178 aa  278  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  34 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  33.97 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  26.8 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  29.45 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  32.65 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  27.1 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  27.03 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  26.35 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  28.39 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  31.69 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  25.99 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  27.67 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  25.55 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  26.92 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  26.16 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  25.71 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  24.63 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  27.54 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4535  hypothetical protein  28.26 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.026025  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  27.82 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  27.27 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  22.29 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  27.54 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  23.13 
 
 		 235 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  28.36 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  28.36 
 
 		 265 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  27.41 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3832  hypothetical protein  19.89 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  24.26 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0763  hypothetical protein  26.09 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652238  normal  0.0879583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  22.39 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3486  hypothetical protein  22.41 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3615  hypothetical protein  22.41 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0819  hypothetical protein  22.41 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0691  hypothetical protein  23.13 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0932  hypothetical protein  25.76 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3632  hypothetical protein  21.97 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4248  hypothetical protein  21.32 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  20 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  21.8 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>