39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1668 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  44.05 
 
 		 200 aa  140  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  39.13 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  39.55 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  39.19 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  35.53 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  34.03 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  37.58 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  36.36 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  36.53 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  33.54 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  34.44 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  33.94 
 
 		 171 aa  89  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  32.41 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  27.59 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  27.33 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  28.48 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  31.98 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  27.53 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  26.35 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  29.82 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  23.13 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  23.78 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0691  hypothetical protein  26.25 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  22.92 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  19.26 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  21.99 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4535  hypothetical protein  21.99 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.026025  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4248  hypothetical protein  21.67 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  20.57 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  23.68 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  22.92 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  23.68 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  26.32 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  23.4 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  26.32 
 
 		 265 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>