8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3832 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3832  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  25.86 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  24 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  19.89 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  24.2 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  21.69 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  23.38 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>