21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0778 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  38.89 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  36.69 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  34.62 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  35.76 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  34.74 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  32.16 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  33.11 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  29.41 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  35.57 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  25.16 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  26.17 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  26.57 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  25.32 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  29.41 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  25.93 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  30.27 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  26.14 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  25.17 
 
 		 167 aa  45.1  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  28.27 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2221  hypothetical protein  25.57 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>