29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3745 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  44.05 
 
 		 182 aa  140  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  41.83 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  40.14 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  39.19 
 
 		 178 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  39.02 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  34.67 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  35.67 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  30.81 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  35.48 
 
 		 180 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  36.77 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  34.86 
 
 		 183 aa  87.8  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  35.66 
 
 		 146 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  29.55 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  29.45 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  38.1 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  38.1 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  28.34 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  30.2 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  28.05 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  29.93 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  25.95 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  24.52 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  34.42 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  26.62 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  31.07 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  25.36 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  30.67 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  32.89 
 
 		 235 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>