36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1561 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  33.73 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  34.48 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  31.77 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  29.38 
 
 		 180 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 177 aa  89  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  30.72 
 
 		 178 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  30.57 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  29.95 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  30.39 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  28.1 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  29.35 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  28.67 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  28.14 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  27.59 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  24.49 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  25.95 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  22.63 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  30.34 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  30.64 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  26.28 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  28.34 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  35.16 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  35.16 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  23.84 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2221  hypothetical protein  22.44 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  22.34 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0691  hypothetical protein  22.86 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  29.63 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0674  hypothetical protein  23.93 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  0.849594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  20.81 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  21.62 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  22.36 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4535  hypothetical protein  22.15 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.026025  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  23.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0932  hypothetical protein  20.98 
 
 		 184 aa  41.6  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>