49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4535 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4535  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.026025  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  96.81 
 
 		 188 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  90.43 
 
 		 188 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0763  hypothetical protein  81.77 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652238  normal  0.0879583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0691  hypothetical protein  66.49 
 
 		 191 aa  247  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  50.28 
 
 		 190 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4248  hypothetical protein  51.18 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0674  hypothetical protein  46 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  0.849594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3486  hypothetical protein  41.86 
 
 		 207 aa  157  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3615  hypothetical protein  41.86 
 
 		 207 aa  157  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0819  hypothetical protein  41.86 
 
 		 207 aa  157  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2221  hypothetical protein  43.65 
 
 		 212 aa  150  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  43.86 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  47.86 
 
 		 236 aa  141  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  47.55 
 
 		 235 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  45.33 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  47.48 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  47.48 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2244  hypothetical protein  45.14 
 
 		 216 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  45.33 
 
 		 174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  45.33 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3082  hypothetical protein  34.86 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0625328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0932  hypothetical protein  32.89 
 
 		 184 aa  98.2  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2755  hypothetical protein  31.17 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.180367  normal  0.0107681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2866  putative periplasmic protein  31.61 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00540777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2887  hypothetical protein  31.61 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0294943  normal  0.352476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2816  putative periplasmic protein  31.61 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2999  hypothetical protein  31.61 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2885  hypothetical protein  31.61 
 
 		 172 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00516229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2990  hypothetical protein  29.8 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3842  hypothetical protein  29.8 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00682027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02456  hypothetical protein  29.8 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1071  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0222313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1080  hypothetical protein  29.8 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.072427  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2887  hypothetical protein  29.8 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0165509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2762  hypothetical protein  29.8 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02492  hypothetical protein  29.8 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  34.69 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  22.36 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  28.26 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  24.24 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  23.9 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  22.08 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  27.37 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  25.56 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  23.66 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  23.84 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  25.44 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  23.03 
 
 		 177 aa  42  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>